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支持对250多个物种的基因组数据进行深度查询，涵盖基因注释、序列提取、变异效应预测、跨物种同源基因识别、调控元件定位及不同基因组版本间的坐标转换，服务于精准的基因组学研究与分析任务。

提供对 NCBI Gene 数据库的深度访问能力，支持按基因符号或编号跨物种检索，获取参考序列、基因本体注释、染色体定位及表型关联等多维信息，并可批量处理、按功能或疾病上下文筛选，适用于基因注释、功能富集与组学分析任务。

实时检索学术文献、技术文档与研究数据，根据问题复杂度智能匹配检索或深度分析模式，优先呈现高影响力论文与权威来源，支持引文追溯与跨领域知识整合，适用于科研验证、技术调研与学术写作辅助。

提供对分子结构的深度解析与精准操控能力，涵盖多种格式的分子读写、自定义化学规则校验、三维构象生成、子结构智能匹配、反应路径模拟、药效团特征提取及分子相似性量化分析，支撑药物发现与计算化学研究全流程。

面向 IBM量子硬件的全栈开发框架，支持量子电路构建、硬件适配优化、跨平台执行（本地模拟器或云上真实设备）、结果分析与可视化，内置误差缓解、运行时服务及专用算法库，适用于企业级量子计算任务。

面向计算材料科学的综合分析平台，支持晶体与分子结构的构建、转换及对称性分析，可生成相图并评估热力学稳定性，解析能带结构与态密度等电子性质，构建表面模型和界面体系，并提供与Materials Project 数据库的程序化对接能力。

面向技术文档的智能发现与分析能力，支持通过标准化llms.txt协议快速定位权威文档，结合GitHub仓库结构化解析、多源并行检索及渐进式回退策略，覆盖最新框架说明、版本化内容、主题定向查询等复杂需求。

提供单细胞多组学数据的深度学习分析能力，支持跨批次整合、多模态联合建模（RNA+蛋白、RNA+ATAC）、空间转录组反卷积、细胞类型标签迁移及RNA速度推断，适用于需要概率建模与潜空间表征的复杂单细胞研究场景。

以学术研究工程师身份开展工作，坚持科学严谨性、理论正确性与形式化验证，聚焦于计算机科学理论到高性能实现的转化，对问题进行批判性分析、精确建模与无妥协实现。

提供基于 Python 的批量 RNA-seq 差异表达分析能力，支持从原始计数数据出发完成标准化、离散度估计、统计检验与多重检验校正全流程，可处理单因素及多因素实验设计，并生成火山图、MA 图等可视化结果，适用于基因表达调控研究和生物标志物筛选。

支持基于约束的代谢建模分析，涵盖基因组尺度模型的加载与存储、代谢通量的平衡与变异性计算、基因或反应敲除模拟、培养基优化、可行通量空间采样、产物生成包络分析及模型修复等能力，服务于系统生物学研究与代谢工程设计。

系统化评估科研工作的方法学严谨性、统计合理性、实验设计、可重复性及伦理合规性，全面审查数据呈现、报告规范与学术诚信，提供跨学科的建设性评审意见，支持论文与基金项目的质量提升。

提供跨学科科研文档的标准化排版支持，覆盖顶级期刊、学术会议、研究海报及基金申请等场景，内置最新模板库、格式规范与自动化校验工具，可一键适配不同出版方的技术要求与写作风格。

提供临床药物基因组学数据查询能力，支持基因与药物相互作用分析、CPIC等权威指南检索、等位基因功能与表型预测、药物流行病学标签解读及代谢通路探索，服务于精准用药决策和个体化剂量调整。

面向生物信息学与微生物组研究的综合分析工具，支持序列处理、多序列比对、系统发育树构建、α/β多样性计算（含UniFrac）、主坐标分析（PCoA）、生态统计检验（PERMANOVA、Mantel）及BIOM/Newick等格式的高效读写。

支持在Coot中直接访问PDBe数据库，获取蛋白质结构的元数据、验证报告、修订历史、配体信息、结合位点及生物组装详情，并通过Solr引擎执行跨PDB的复杂检索，辅助结构质量评估与相关构象发现。

提供一套系统化、多维度的学术研究质量评估能力，覆盖问题提出、文献综述、方法设计、数据分析、结果阐释及学术写作等核心环节，支持针对论文、综述、提案等不同学术成果的结构化评审与建设性反馈，兼顾学科特性与研究阶段差异。

协助用户完成高质量内容创作的全流程协作，涵盖选题构思、结构化提纲设计、针对性资料检索与规范引注、开篇钩子优化、分章节实时反馈、多轮迭代润色，并全程保持作者独特的语言风格与表达调性，适用于博客、教程、案例研究及技术文档等多种写作场景。

面向基因组学研究，提供对250多个物种的全面查询能力，包括基因定位、序列提取、变异效应预测、跨物种同源基因识别、基因组区域注释及不同参考基因组间的坐标转换。

通过分步规划与并行子任务协作，实现对复杂主题的深度网络调研，支持多源信息采集、结构化整理及综合分析，适用于需跨领域资料整合的研究场景。

面向开发者提供多路径技术文档检索能力，优先定位标准化的 llms.txt 文档，缺失时自动转向 GitHub 仓库深度分析或并行网络研究，支持版本精准匹配与结果智能聚合，确保获取最新、权威、结构化的开发参考资料。

提供对NHGRI-EBI GWAS Catalog的深度查询能力，支持按SNP位点、疾病性状、基因名称或染色体区域检索遗传关联信息，获取p值、效应大小及完整统计摘要，服务于遗传流行病学研究、多基因风险评分构建与功能基因组学分析。

协助用户完成从选题到发布的完整写作过程，通过协同构建大纲、补充权威引用、优化开篇吸引力、逐段提供反馈来提升内容质量，在保持作者原有风格的基础上实现高效迭代，适用于撰写深度文章、技术文档或案例研究等需要严谨结构与可信度的内容创作场景。

自动生成符合 arXiv 规范的机器学习与人工智能领域综述论文，基于 IEEEtran 模板构建完整 LaTeX 项目，包含结构化写作计划、可验证的 BibTeX 参考文献、多类型可视化图表及严格的质量管控流程。

面向科研论文与期刊投稿的全流程写作支持，涵盖IMRAD结构化组织、多风格文献引用、符合CONSORT/STROBE/PRISMA等规范的透明报告、图表设计与学科术语适配，严格遵循段落式行文原则，通过研究检索支撑的两阶段法（先提纲后成文）生成严谨、清晰、可发表的学术文本。

面向量子计算研究与工程实践，提供从电路设计、噪声建模、硬件适配到实验分析的全栈支持，特别适用于 Google 量子处理器部署、含噪中等规模量子算法开发及底层电路优化任务。

支持跨多个学术数据库开展系统性文献综述，覆盖生物医学与前沿科技领域，能自动聚合检索结果、去重筛选、按主题归纳研究发现，并生成带验证引用的规范化学术文档及PDF，强制嵌入AI生成的科研示意图以增强表达。

提供对数字病理全切片图像的轻量级处理能力，支持自动识别组织区域、按随机/网格/评分策略提取图像块，并实现H&E染色归一化等预处理操作，适用于快速构建训练数据集或开展基于图像块的初步分析。

面向科研论文与学术出版的全流程写作支持，涵盖IMRAD结构化组织、多格式文献引用、图表规范设计、研究类型适配的报告标准（如CONSORT/STROBE/PRISMA），以及跨学科术语精准表达；严格遵循两阶段写作法——先基于文献检索构建逻辑要点提纲，再转化为连贯段落，杜绝列表式表述。

提供对基因组数据的全流程处理能力，支持高效读写 SAM/BAM/CRAM 比对文件、VCF/BCF 变异文件及 FASTA/FASTQ 序列文件，可按区域提取 reads 或变异位点、计算覆盖深度、进行 pileup 分析，并整合多类数据完成质量控制、变异验证与序列上下文提取等生物信息学任务。